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  wepoker平台维生素d吃多久停一次卵白质正在生物体内饰演着不成或缺的脚色,凿凿预测其▽成效对 ○待实践使用○至闭主要。假使高通量技艺○ 增进了卵白质序列数据的激增,但揭示卵白质的真实成效依然必要多量工夫和资源。目前,很众技巧 都 依赖于卵白质序列举办预测,而针对卵白质构造的技巧很 少。

  为了应对这些离间,东北大学的推敲职员从卵白质构★○造动身,提出将卷积神经汇集 (CNN)和图卷积汇集 (GCN)连系成一个联合框架,称为双模子自适宜 权重协调汇集 (Two-model Adaptive Weight Fusion Network,TAWFN),用于卵白质成效预测。

  开辟一种 ○凿凿有=用 □ 的卵白质 成效预测技巧至闭…主要。现在预测 卵△白 质成效的○技 巧要紧蚁合正在三个周围:卵白质序列、卵白质构造和卵白质-卵白质互相效率○汇集。

  现在针对卵白质构造的技巧很少,时时零丁操纵卷积…神经汇集(CNN) 或 图卷 积□汇集 (GCN)。零丁操纵 CNN 或 GCN□ 存正在以下题 目。

  操纵 ◁ =C NN 时恐怕会发作新闻遗失,由于它们的限度担当场恐怕★无法==◁捕获卵白质的全部构造。若是闭节特色漫衍正在很大的▽区域,CNN 恐怕会○由于只 闭怀限度区域而错过它们维生素d吃众久停一次■=。同样,对待 GCN,若是 卵白质构造 ★具■有图卷 △积层无法□★一律捕获 的繁复相闭,则会导 =致卵白质特色的显露不完好。

  G CN 更适合统 治图构造 数据,而 CNN■ 更适 合 序列数据。仅操纵个中一个汇集恐怕=无法○一律逮捕卵白质中的种种新闻,从而导致特色显露受限。当卵白质构 造同○ 时蕴▽涵序列▽和图新闻时,仅依赖一品种型的汇集无法充实使用这些分歧的原因,从而▽局限了对卵白质构○造的总共剖■□释。

  为清楚决这些题目,东北○大学推敲职员提 出了一种新型卵白质成效预 测技巧TAWFN。该技巧=集成了 C N N 和 GCN,同时使 用了卵白质构造和卵白质言语模子。对卵白质构造举办统治,取得相应的卵白质序列。

  正在 GCN 方面,操纵△途 理后的卵…白质 序列特色和卵白质接触图修 筑图…形■输入▽ 汇集。操纵 GCN 编码器○来逮捕△短程新闻,并引入 Tra△nsformers 来□逮捕长 程新闻。为了更好地剖释拓扑语义,使用注意机 ○制来 天生图显 露。

  正在卷积汇集方面,操纵途理后的卵白质□序列特色动作输入。操纵众层卷积编码器,个中众个卷积层级联。别的,将特色金字■ ○塔△构造与众标准深度特色提 ○取器□□集成 正在沿途以逮捕限○度特○色。别的,引入了众头注意机制来逮○捕 众标准限度特色之 间的长程依赖相闭。

  通过采用△自适宜权重估○计,将两 个 汇 集○的开始预测结果协调,取得最终的预测结果。

  通过多量尝试,将 TA WFN 与基线技○巧举办斗劲,结果证明,模子还外示出■卓越的通用性和可评释 ○性,证明连 系两种技 巧可能…升高效力。

  简直而言,TA★WFN …的构造如 下…图所示,要紧由四个模块构成:(1)输入数据天生模块:该模块天 生卵 ○白质接触图和○序列编码=◁特 色,包含 ES▽M-1b 编码 和独◁热编码。(2)基于 G=CN○ 的 AGCN 模块:该模块包含两△个子模○块 AGCN1和 AGCN2,两个子 模块正在统治分歧的输入时共享统一个 A■G…CN 汇集。它爆发开始的预测结果!

  为了评估技巧的有用性,推敲职 员正…在 PD ◁Bset 和 AFset 数据集长进行了尝试wpk德州维生素d简介蛋白质的功能。。要紧操纵目标 Fmax、Smi…n和 A○UPR 来评估技○巧的本 能。Fma x△目标显 露正在全体预 测阈值上估计★出的◁最大 F 值。Smin显露预测 诠释和切实诠释之间的语义隔绝,酌量到○每个 = 函 数的新闻实质。AUPR 操纵 梯形条□例近似估计正确度-召回率弧线下的面积,评估 模子正在分歧预测 阈值上的本能。Smin值越低越。